Protein–RNA interactions for Protein: Q14511

NEDD9, Enhancer of filamentation 1, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD9Q14511 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC068733.3-201ENST00000632757 269 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 MIR548H3-201ENST00000408771 118 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
NEDD9Q14511 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 CALM2P4-201ENST00000430810 426 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 TRAJ39-201ENST00000390498 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 U8.16-201ENST00000391279 133 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-1271P-201ENST00000517049 105 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR4421-201ENST00000578133 69 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-379P-201ENST00000363813 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-955P-201ENST00000410497 104 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC005908.1-201ENST00000468701 347 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC078980.1-201ENST00000485384 262 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AP000942.4-201ENST00000604811 241 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AL161935.2-201ENST00000414627 60 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 JTBP1-201ENST00000441314 247 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
NEDD9Q14511 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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