Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AL049861.1-201ENST00000603130 150 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AL603908.1-201ENST00000406098 201 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 SAMD9L-201ENST00000318238 7134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
CKAP5Q14008 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-886P-201ENST00000384319 105 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 TRAJ49-201ENST00000390488 56 ntAPPRIS P1 BASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-426P-201ENST00000516464 97 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIR3910-1-201ENST00000580936 111 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.78□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 ATP11C-201ENST00000327569 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AC009930.1-201ENST00000522330 191 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MTND2P29-201ENST00000438595 412 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIR6840-201ENST00000611937 71 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.357-201ENST00000365487 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 AL117342.1-201ENST00000404861 406 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNA5SP489-201ENST00000410986 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU7-200P-201ENST00000516105 62 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIR4419B-201ENST00000577260 68 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
CKAP5Q14008 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.6 ms