Protein–RNA interactions for Protein: Q13950

RUNX2, Runt-related transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX2Q13950 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.62□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.61□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.6□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AL136320.1-201ENST00000417273 430 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MIR4285-201ENST00000581001 85 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.59□□□□□ -2.15
RUNX2Q13950 MBNL3-212ENST00000538204 11294 ntTSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 Y_RNA.292-201ENST00000364904 97 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 RNY4P28-201ENST00000365281 93 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 HSPE1P24-201ENST00000450782 238 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.58□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
RUNX2Q13950 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms