| RUNX2 | Q13950 | HFM1-201 | ENST00000370425 | 4931 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1123P-201 | ENST00000362347 | 106 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.140-201 | ENST00000363474 | 103 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-1209P-201 | ENST00000363655 | 107 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD27-201 | ENST00000363981 | 72 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU4-10P-201 | ENST00000364383 | 140 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-144P-201 | ENST00000383951 | 107 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR660-201 | ENST00000385235 | 97 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-78P-201 | ENST00000391248 | 165 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.590-201 | ENST00000410140 | 107 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-383P-201 | ENST00000410864 | 94 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL31P63-201 | ENST00000422565 | 375 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | NDUFA4P2-201 | ENST00000489989 | 244 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC055733.2-201 | ENST00000504737 | 340 nt | TSL 2 BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC110009.1-201 | ENST00000512965 | 451 nt | TSL 5 BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC100767.1-201 | ENST00000528178 | 123 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3122-201 | ENST00000577243 | 73 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TTC28-AS1_2.1-201 | ENST00000611117 | 157 nt | BASIC | 1.63 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR126-201 | ENST00000362291 | 85 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD68-201 | ENST00000363214 | 84 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.572-201 | ENST00000384757 | 98 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6ATAC15P-201 | ENST00000408279 | 121 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL353747.2-201 | ENST00000439207 | 205 nt | TSL 3 BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD11-201 | ENST00000459124 | 84 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | BX284668.6-201 | ENST00000606899 | 438 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL021707.8-201 | ENST00000609428 | 183 nt | BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | FANCD2-213 | ENST00000625535 | 117 nt | TSL 5 BASIC | 1.62 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.269-201 | ENST00000364685 | 89 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL627390.1-201 | ENST00000396055 | 340 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNRPGP10-201 | ENST00000432323 | 225 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL603825.1-201 | ENST00000438481 | 80 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC068658.1-201 | ENST00000507509 | 388 nt | TSL 2 BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3618-201 | ENST00000580330 | 88 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL442067.1-201 | ENST00000613261 | 223 nt | BASIC | 1.61 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-653P-201 | ENST00000363074 | 106 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.293-201 | ENST00000364908 | 93 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.304-201 | ENST00000365011 | 112 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.478-201 | ENST00000384358 | 107 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR526A2-201 | ENST00000390198 | 65 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC245517.4-201 | ENST00000448601 | 281 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-111P-201 | ENST00000517179 | 105 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC016885.2-201 | ENST00000522598 | 261 nt | TSL 3 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4778-201 | ENST00000577635 | 80 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025887.1-201 | ENST00000578349 | 264 nt | TSL 3 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4422-201 | ENST00000581938 | 83 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL365265.1-201 | ENST00000621045 | 234 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD3E-202 | ENST00000627253 | 216 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | ICE2P2-201 | ENST00000483823 | 2787 nt | BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC025539.1-201 | ENST00000515343 | 4019 nt | TSL 2 BASIC | 1.6 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD33-201 | ENST00000362761 | 85 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD50B-201 | ENST00000364995 | 70 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.338-201 | ENST00000365320 | 114 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RN7SKP101-201 | ENST00000411376 | 320 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL136320.1-201 | ENST00000417273 | 430 nt | TSL 3 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.679-201 | ENST00000516416 | 91 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC087362.2-201 | ENST00000529325 | 256 nt | TSL 3 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL23AP91-201 | ENST00000569211 | 455 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4285-201 | ENST00000581001 | 85 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001109.1-201 | ENST00000587114 | 279 nt | TSL 3 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC120024.3-201 | ENST00000603167 | 156 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | TP73-AS1.1-201 | ENST00000611447 | 161 nt | BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SPTSSB-205 | ENST00000620149 | 231 nt | APPRIS P1 BASIC | 1.59 | □□□□□ -2.15 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MBNL3-212 | ENST00000538204 | 11294 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY1-201 | ENST00000364228 | 113 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.292-201 | ENST00000364904 | 97 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORD1A-201 | ENST00000364968 | 72 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNY4P28-201 | ENST00000365281 | 93 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR626-201 | ENST00000385032 | 94 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR513A1-201 | ENST00000385138 | 129 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MT-TG-201 | ENST00000387429 | 68 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MLLT10P1-201 | ENST00000418346 | 262 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RPL30P13-201 | ENST00000418873 | 348 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | PIGPP3-201 | ENST00000425307 | 415 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP001043.2-201 | ENST00000434589 | 288 nt | TSL 3 BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | HSPE1P24-201 | ENST00000450782 | 238 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC093850.1-201 | ENST00000454121 | 251 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | CYCTP-201 | ENST00000504253 | 315 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC114811.1-201 | ENST00000507207 | 168 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.676-201 | ENST00000516393 | 96 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA25.15-201 | ENST00000516487 | 89 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SUMO2P16-201 | ENST00000519475 | 264 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC024614.2-201 | ENST00000577584 | 372 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR4724-201 | ENST00000579485 | 89 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.802-201 | ENST00000614892 | 130 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027279.3-201 | ENST00000625055 | 122 nt | BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SEMG2-201 | ENST00000372769 | 2051 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.58 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AL442644.1-201 | ENST00000454390 | 3105 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR367-201 | ENST00000362299 | 68 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.65-201 | ENST00000362846 | 100 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU1-17P-201 | ENST00000363022 | 152 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | SNORA20.1-201 | ENST00000364790 | 130 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | Y_RNA.401-201 | ENST00000383965 | 117 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNU6-131P-201 | ENST00000391144 | 107 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC027119.1-201 | ENST00000440877 | 241 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC122707.1-201 | ENST00000502882 | 219 nt | TSL 2 BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AC137770.1-201 | ENST00000504620 | 530 nt | TSL 3 BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | RNA5SP445-201 | ENST00000515889 | 115 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR3683-201 | ENST00000580847 | 82 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | MIR2681-201 | ENST00000581814 | 105 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |
| RUNX2 | Q13950 | AP000942.3-201 | ENST00000603702 | 160 nt | BASIC | 1.57 | □□□□□ -2.16 | | |