Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-126P-201ENST00000516685 103 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SNORA81.3-201ENST00000517283 198 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 DEFB131B-201ENST00000530210 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.75□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.274-201ENST00000364714 101 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-1031P-201ENST00000384773 107 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-493P-201ENST00000391321 108 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MTND5P15-201ENST00000434246 349 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 CPHL1P-203ENST00000471823 523 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 ZNF260-205ENST00000593142 4047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.74□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC104984.5-201ENST00000586878 94 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.73□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR676-201ENST00000390702 67 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-1228P-201ENST00000391014 107 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.72□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.571-201ENST00000384753 98 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL136985.1-201ENST00000424592 395 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR4662B-201ENST00000579498 81 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR502-201ENST00000606349 86 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.71□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 WWP1P1-201ENST00000466609 2769 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 snoU13.23-201ENST00000458863 104 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
PKP1Q13835 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.7□□□□□ -2.14
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