Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

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Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC0.17□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-801P-201ENST00000364087 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-994P-201ENST00000410507 111 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU2-16P-201ENST00000410712 136 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-602P-201ENST00000411155 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 LINC00345-201ENST00000443679 285 ntTSL 5 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 PISRT1.1-201ENST00000616930 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNA5SP48-201ENST00000363969 126 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 MIR140-201ENST00000385282 100 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 MIR4305-201ENST00000583252 102 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 AC060780.3-201ENST00000589464 80 ntBASIC0.16□□□□□ -2.38
CACNA1SQ13698 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-626P-201ENST00000363354 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MTND3P8-201ENST00000412909 339 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC103591.3-201ENST00000608684 209 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC0.15□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 SNORD44.1-201ENST00000363202 61 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-448P-201ENST00000517052 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 SNORD38B-202ENST00000625943 69 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 NCKAP5-IT1-201ENST00000416437 554 ntTSL 4 BASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-1016P-201ENST00000516689 94 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR5701-1-201ENST00000585138 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR5701-2-201ENST00000615634 82 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC022079.1-201ENST00000621546 602 ntBASIC0.14□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MTND3P10-201ENST00000450967 341 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.13□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 MIR1295A-201ENST00000408463 79 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU4-24P-201ENST00000364565 139 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 SNORA40.5-201ENST00000391061 128 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
CACNA1SQ13698 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.12□□□□□ -2.39
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