Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 RNU6-514P-201ENST00000384208 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR568-201ENST00000385036 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC037487.3-201ENST00000606668 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.396-201ENST00000383949 103 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-1065P-201ENST00000384513 106 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL161722.3-201ENST00000605789 2983 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-392P-201ENST00000364926 101 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.676-201ENST00000516393 96 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
CDH18Q13634 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
CDH18Q13634 RNU6ATAC3P-201ENST00000387974 126 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
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