Protein–RNA interactions for Protein: Q13596

SNX1, Sorting nexin-1, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX1Q13596 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU6-110P-201ENST00000384508 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 SNORD99-201ENST00000408612 74 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 COX6CP6-201ENST00000490840 228 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Y_RNA.143-201ENST00000363520 106 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 FGF7P4-201ENST00000509595 295 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 SENP7-207ENST00000394095 4945 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.65□□□□□ -2.3
SNX1Q13596 Y_RNA.80-201ENST00000362996 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.529-201ENST00000384586 119 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-976P-201ENST00000516086 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNY3-201ENST00000365484 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6ATAC19P-201ENST00000408096 110 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-875P-201ENST00000516488 106 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC004812.1-201ENST00000540773 146 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AL590095.2-201ENST00000604136 117 ntBASIC0.64□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.303-201ENST00000364998 94 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.63□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.58-201ENST00000362807 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 Y_RNA.154-201ENST00000363624 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNY3P1-201ENST00000365085 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-1009P-201ENST00000390996 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR2115-201ENST00000516657 100 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
SNX1Q13596 AC006157.1-201ENST00000611750 366 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 912.4 ms