Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.53□□□□□ -2.16
NAE1Q13564 TP73-AS1.1-201ENST00000611447 161 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NAE1Q13564 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
NAE1Q13564 ABCA5-201ENST00000392676 8220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
NAE1Q13564 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.54-201ENST00000362766 105 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.350-201ENST00000365409 98 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.52□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.416-201ENST00000384014 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU1-78P-201ENST00000391248 165 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.51□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 LINC01073-201ENST00000441659 149 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SAGE1-201ENST00000324447 2952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.679-201ENST00000516416 91 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR5688-201ENST00000580619 83 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.20-201ENST00000362479 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.76-201ENST00000362931 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.673-201ENST00000516306 88 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.447-201ENST00000384184 113 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.478-201ENST00000384358 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SNORD58.1-201ENST00000391313 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 FAS-AS1.2-201ENST00000620386 170 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
NAE1Q13564 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NAE1Q13564 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NAE1Q13564 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NAE1Q13564 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
NAE1Q13564 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
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