Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.201-201ENST00000364052 96 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP451-201ENST00000410588 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Z95118.1-201ENST00000421372 247 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MTCO2P4-201ENST00000517968 247 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP475-201ENST00000410568 110 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP476-201ENST00000516613 103 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORA70.25-201ENST00000612741 95 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP98-201ENST00000363158 137 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORA75.1-201ENST00000391130 148 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MTND2P18-201ENST00000419962 1030 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU4-20P-201ENST00000365601 151 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNA5SP25-201ENST00000410815 110 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR4432-201ENST00000581823 84 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 U7.6-201ENST00000610841 64 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 CCDC7-215ENST00000639629 4158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
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ITGB3BPQ13352 SNORD95.1-201ENST00000364099 68 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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ITGB3BPQ13352 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 MIR1265-201ENST00000408444 86 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC138749.4-201ENST00000563970 127 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
ITGB3BPQ13352 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC-0.84□□□□□ -2.54
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ITGB3BPQ13352 MIR6086-201ENST00000638065 55 ntBASIC-0.85□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
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ITGB3BPQ13352 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC244250.2-201ENST00000418731 148 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AL390783.1-203ENST00000457058 248 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
ITGB3BPQ13352 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
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