Protein–RNA interactions for Protein: Q13185

CBX3, Chromobox protein homolog 3, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX3Q13185 Y_RNA.168-201ENST00000363740 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR92A1-201ENST00000385233 78 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.619-201ENST00000410951 90 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC0.57□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU7-110P-201ENST00000516891 62 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AP003484.1-201ENST00000530974 250 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC0.56□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC008507.4-201ENST00000585464 127 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RPS29P30-201ENST00000600975 111 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AL121655.1-201ENST00000605811 308 ntBASIC0.55□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.54□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR508-201ENST00000384857 115 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 RNA5SP102-201ENST00000516865 106 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC0.53□□□□□ -2.32
CBX3Q13185 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AL049869.2-201ENST00000556634 365 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MIR548AO-201ENST00000579992 96 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.505-201ENST00000384489 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-21P-201ENST00000384710 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SNORA40.14-201ENST00000516543 86 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC092447.9-201ENST00000603395 144 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 HECTD2-202ENST00000371667 4354 ntTSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 C18orf54-201ENST00000300091 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU6-1248P-201ENST00000391096 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU7-152P-201ENST00000458982 64 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MIR1302-1-201ENST00000637932 143 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 RN7SKP12-201ENST00000516275 143 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CBX3Q13185 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
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