Protein–RNA interactions for Protein: Q13136

PPFIA1, Liprin-alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIA1Q13136 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 SNORD26-201ENST00000384147 75 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 MTCO1P5-201ENST00000433573 344 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
PPFIA1Q13136 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.64-201ENST00000362845 102 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR26B-201ENST00000362251 77 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR526A1-201ENST00000384897 85 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-165P-201ENST00000517170 99 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AL442663.2-201ENST00000554385 511 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC019288.1-201ENST00000557918 224 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNA5SP327-201ENST00000362494 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
PPFIA1Q13136 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-713P-201ENST00000384761 107 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR3660-201ENST00000584845 100 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR758-201ENST00000390227 88 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORD111.1-201ENST00000516421 86 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PPFIA1Q13136 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
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