Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 FAM106DP-201ENST00000586416 501 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.16-201ENST00000362421 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.336-201ENST00000365307 109 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.338-201ENST00000365320 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL603825.1-201ENST00000438481 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RPS29P28-201ENST00000446439 141 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MTND5P22-201ENST00000458380 195 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 RNU2-31P-201ENST00000516954 155 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR6078-201ENST00000611069 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
RBBP4Q09028 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.84-201ENST00000363011 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.326-201ENST00000365176 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-326P-201ENST00000365480 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1143P-201ENST00000516125 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR516B2-201ENST00000385190 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL133373.1-201ENST00000497098 94 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC138625.2-201ENST00000563968 551 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 IL6ST-203ENST00000381287 8667 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1109P-201ENST00000391187 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU7-40P-201ENST00000516397 64 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL096861.1-201ENST00000610899 123 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-694P-201ENST00000364071 147 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 ZNF518A-210ENST00000624776 7994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORA25.1-201ENST00000362326 128 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 Y_RNA.422-201ENST00000384054 114 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AC245047.7-201ENST00000440265 293 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1338P-201ENST00000516328 91 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR3192-201ENST00000584920 77 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 RNU6-1160P-201ENST00000384546 104 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MIR136-201ENST00000385207 82 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
RBBP4Q09028 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109.5 ms