Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.62□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RGPD6-201ENST00000329516 7165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.37-201ENST00000362606 108 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.369-201ENST00000365568 117 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-1014P-201ENST00000383940 103 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORA44-201ENST00000384584 132 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RN7SKP284-201ENST00000411002 343 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 EEF1A1P41-201ENST00000414667 207 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORD45.4-201ENST00000516629 73 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.61□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-349P-201ENST00000362402 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MIR1302-5-201ENST00000408164 150 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC021443.1-201ENST00000604478 211 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.198-201ENST00000364013 98 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 Y_RNA.362-201ENST00000365518 110 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 RNU7-70P-201ENST00000516941 66 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AC024995.1-201ENST00000523014 93 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AP001363.1-201ENST00000544108 264 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AP001318.4-201ENST00000616637 121 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 ANKRD18EP-201ENST00000405487 2632 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
CHRNEQ04844 AL589743.1-201ENST00000551932 2712 ntBASIC2.59□□□□□ -2
CHRNEQ04844 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-1131P-201ENST00000364955 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC022523.2-201ENST00000561045 150 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC090616.3-202ENST00000583346 205 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 ERBIN-202ENST00000380935 6692 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 Y_RNA.440-201ENST00000384120 114 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-1104P-201ENST00000384723 104 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNORA80E-201ENST00000384744 137 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR515-2-201ENST00000384883 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNORA19.1-201ENST00000410656 129 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AL139132.1-201ENST00000431587 344 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-109P-201ENST00000516364 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 RNU6-184P-201ENST00000516514 107 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 SNORA18.7-201ENST00000516910 131 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.57□□□□□ -2
CHRNEQ04844 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC2.57□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 113.4 ms