Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 LINC00363-201ENST00000443228 210 ntTSL 5 BASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR4324-201ENST00000584846 72 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC018714.1-201ENST00000605028 208 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 DLX6-AS1_2.1-201ENST00000613701 207 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR6738-201ENST00000619620 64 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR655-201ENST00000362159 97 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC084290.1-201ENST00000434995 374 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 ST7-OT4_4.1-201ENST00000614993 213 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR8066-201ENST00000617280 78 ntBASIC-0.94□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR8055-201ENST00000610739 97 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC-0.95□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 Y_RNA.477-201ENST00000384352 108 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-456P-201ENST00000384493 107 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 UBE2D3P4-201ENST00000441973 436 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 LYRM7-202ENST00000507584 317 ntTSL 2 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AL590491.3-201ENST00000610731 82 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-0.96□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 MIR365A-201ENST00000362260 87 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU7-67P-201ENST00000459003 62 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-0.97□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNY3P9-201ENST00000384727 106 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR563-201ENST00000385080 79 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1242P-201ENST00000391052 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1265P-201ENST00000516342 103 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC069431.2-201ENST00000604149 1099 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC-0.98□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Y_RNA.32-201ENST00000362589 110 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1162P-201ENST00000384443 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Y_RNA.536-201ENST00000384621 113 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR6507-201ENST00000613630 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-765P-201ENST00000516916 99 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 CYP19A1-220ENST00000613097 123 ntTSL 5 BASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR7844-201ENST00000616161 122 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-0.99□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR876-201ENST00000401147 81 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-958P-201ENST00000516995 106 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AP002963.1-201ENST00000530590 184 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 MIR6082-201ENST00000613604 109 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 AL162376.1-201ENST00000624117 175 ntBASIC-1□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
PTPRMP28827 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.01□□□□□ -2.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 189.1 ms