Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 VTRNA1-3-201ENST00000365645 89 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-1199P-201ENST00000411249 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 KCNQ1OT1_3.1-201ENST00000616504 116 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC0.52□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 ZNF654-201ENST00000309495 4957 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-654P-201ENST00000364373 107 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.549-201ENST00000384657 102 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MTND1P34-201ENST00000438556 671 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.51□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 CCDC73-201ENST00000335185 3849 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.148-201ENST00000363557 117 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORD113.3-201ENST00000364630 78 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-890P-201ENST00000384121 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORA2B-201ENST00000384583 137 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-192P-201ENST00000391253 100 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MTND1P4-201ENST00000435196 415 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 TRBVB-201ENST00000477100 408 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR4659A-201ENST00000580269 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 WT1-AS_8.1-201ENST00000615200 275 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SLC8A1-AS1-230ENST00000627538 212 ntTSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR6516-201ENST00000630554 81 ntBASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 ZNF518A-209ENST00000614149 7911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.5□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNA5SP95-201ENST00000410319 137 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AL392103.1-201ENST00000447000 198 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AL157398.1-201ENST00000452981 186 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 ZBTB41-201ENST00000367405 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.49□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-1188P-201ENST00000363795 107 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR1302-7-201ENST00000408841 72 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNA5SP222-201ENST00000411039 105 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
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CLDN9O95484 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC0.48□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.160-201ENST00000363677 92 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU4-40P-201ENST00000364351 143 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 Y_RNA.314-201ENST00000365114 102 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORA36.2-201ENST00000384004 127 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SNORD105-201ENST00000386910 85 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR1827-201ENST00000408549 66 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 FCF1P9-201ENST00000412546 282 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MCFD2P1-201ENST00000417812 300 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AC022441.3-201ENST00000605737 136 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC0.47□□□□□ -2.33
CLDN9O95484 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Y_RNA.599-201ENST00000410489 109 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 RN7SKP295-201ENST00000517264 153 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.46□□□□□ -2.34
CLDN9O95484 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC0.45□□□□□ -2.34
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