Protein–RNA interactions for Protein: J3KRW8

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

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Length 73 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KRW8 MIR1289-2-201ENST00000408360 111 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORD11-201ENST00000459124 84 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU11-2P-201ENST00000516898 142 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORD53B-201ENST00000577887 78 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
J3KRW8 CENPQ-201ENST00000335783 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.330-201ENST00000365230 109 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR942-201ENST00000401111 86 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 POLR2J4-204ENST00000418424 324 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORD124-201ENST00000459577 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR4251-201ENST00000635819 61 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
J3KRW8 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORA25.3-201ENST00000363205 127 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC006441.5-201ENST00000612680 209 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
J3KRW8 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR548AR-201ENST00000582191 57 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 ABCA9-AS1-203ENST00000627596 426 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR320A-201ENST00000385302 82 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
J3KRW8 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 RNU1-42P-201ENST00000364033 160 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
J3KRW8 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 AL603910.2-201ENST00000407268 136 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 MIR1261-201ENST00000408659 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 AC113618.1-201ENST00000416747 285 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 AC092071.1-201ENST00000597260 549 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
J3KRW8 C9orf84-204ENST00000394777 4955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 Y_RNA.293-201ENST00000364908 93 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 RNU1-36P-201ENST00000365130 165 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 SNORD28B-201ENST00000390993 75 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 AL731563.1-201ENST00000442202 214 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
J3KRW8 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
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