Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMW8

USP18, Ubl carboxyl-terminal hydrolase 18, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP18Q9UMW8 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNRPGP8-201ENST00000454064 226 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNA5SP82-201ENST00000516707 92 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.703-201ENST00000516846 111 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AL121914.1-201ENST00000450188 156 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MIPOL1-203ENST00000537471 5954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU1-52P-201ENST00000384190 164 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.587-201ENST00000391210 103 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC110009.1-201ENST00000512965 451 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-643P-201ENST00000384018 107 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-295P-201ENST00000516901 104 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.36□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
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USP18Q9UMW8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
USP18Q9UMW8 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.34□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AC023449.1-201ENST00000454464 154 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
USP18Q9UMW8 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
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