Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 RNU6-80P-201ENST00000384195 107 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC234781.5-202ENST00000453508 426 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC131055.1-201ENST00000584626 316 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 ZMYM1-203ENST00000373330 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 MTATP6P29-201ENST00000415057 132 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 MIR4635-201ENST00000583759 79 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 ELOCP29-201ENST00000588193 334 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC005786.1-201ENST00000588553 154 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC007751.1-201ENST00000529260 376 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 SNORD68-201ENST00000363214 84 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
BRPF3Q9ULD4 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.120-201ENST00000363304 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.629-201ENST00000411368 105 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AC245047.3-201ENST00000429428 127 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.686-201ENST00000516548 134 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AL365205.2-201ENST00000594586 68 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AL359881.1-201ENST00000602916 267 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORD61-201ENST00000384252 73 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP127-201ENST00000411051 133 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AL135790.1-201ENST00000427161 157 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.294-201ENST00000364916 102 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORD24-201ENST00000383884 75 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORA1-201ENST00000384107 130 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR624-201ENST00000385217 97 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AC096725.1-201ENST00000514266 313 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP356-201ENST00000515972 94 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP282-201ENST00000516355 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.692-201ENST00000516627 105 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1270P-201ENST00000517128 108 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 CEP57L1-213ENST00000520883 2055 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR3129-201ENST00000581095 76 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNU6-888P-201ENST00000363010 101 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SNORD18B-201ENST00000365659 72 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 RNU6-659P-201ENST00000516454 104 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
BRPF3Q9ULD4 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
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