Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU2-55P-201ENST00000411146 174 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL360175.1-201ENST00000426547 285 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 NDUFA4P2-201ENST00000489989 244 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL160236.1-201ENST00000556317 195 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR548X2-201ENST00000579776 100 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 LINC01359-207ENST00000634799 487 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.343-201ENST00000365354 112 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP289-201ENST00000362332 137 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-197P-201ENST00000516680 100 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR3646-201ENST00000578301 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SH3BP4Q9P0V3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.251-201ENST00000364551 99 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 OGN-202ENST00000375561 2743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.91-201ENST00000363042 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1082P-201ENST00000364574 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-959P-201ENST00000384671 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 MIR515-1-201ENST00000384884 83 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR378D2-201ENST00000580636 98 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MTND4LP9-201ENST00000427694 174 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SH3BP4Q9P0V3 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.66-201ENST00000362862 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.486-201ENST00000384398 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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