Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP168-201ENST00000516642 112 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
HOXD1Q9GZZ0 AC011604.2-202ENST00000540229 2451 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR1323-201ENST00000408090 73 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR7843-201ENST00000622274 79 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 ZGRF1-208ENST00000505019 6652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNA5SP259-201ENST00000365541 109 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-424P-201ENST00000384367 105 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR513A1-201ENST00000385138 129 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC093850.1-201ENST00000454121 251 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 SNORA27.4-201ENST00000516650 95 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.117-201ENST00000363294 101 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 PIGPP3-201ENST00000425307 415 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MTND4LP30-201ENST00000454092 297 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC108210.2-201ENST00000503681 201 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC015712.3-201ENST00000559380 164 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 snoU18.1-201ENST00000629629 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.31□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR302D-201ENST00000362275 68 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 SNORD1A-201ENST00000364968 72 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-574P-201ENST00000384265 107 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-651P-201ENST00000411040 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC108752.1-201ENST00000484679 576 ntTSL 5 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU7-12P-201ENST00000516030 62 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC012433.1-201ENST00000588916 398 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL008718.3-201ENST00000610217 321 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.29□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-1209P-201ENST00000363655 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
HOXD1Q9GZZ0 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
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