Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTR2

NLRC3, NLR family CARD domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,065 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRC3Q7RTR2 MIR5194-201ENST00000582634 120 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC2.61□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 ZNF680-202ENST00000447137 2159 ntTSL 2 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP374-201ENST00000362939 125 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.280-201ENST00000364765 112 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.353-201ENST00000365440 108 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 SNORD77.3-201ENST00000391113 65 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 AC022018.1-201ENST00000430685 241 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 AL158147.1-201ENST00000443970 75 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-826P-201ENST00000516827 104 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 AC107016.2-201ENST00000547968 190 ntBASIC2.6□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 MTND5P32-201ENST00000560711 1802 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU6-772P-201ENST00000516042 105 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 RNU7-25P-201ENST00000516544 62 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.712-201ENST00000517011 92 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 AC134878.1-201ENST00000619901 243 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 AC091953.5-201ENST00000622919 233 ntBASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -1.99
NLRC3Q7RTR2 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.59□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 ZBTB26-202ENST00000373656 4443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-508P-201ENST00000363231 103 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORA71.1-201ENST00000364523 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.563-201ENST00000384707 108 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC114811.1-201ENST00000507207 168 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP341-201ENST00000516261 117 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 OR51A4-202ENST00000641898 4393 ntAPPRIS P1 BASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.58□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR22-201ENST00000362190 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORD20-201ENST00000384550 80 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR23A-201ENST00000385245 73 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC131956.1-201ENST00000506420 258 ntTSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1149P-201ENST00000516810 97 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC138907.4-201ENST00000570107 226 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.57□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORD115-28-201ENST00000363931 81 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.410-201ENST00000383992 113 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.547-201ENST00000384654 119 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNA5SP236-201ENST00000516169 116 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1061P-201ENST00000516530 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIR5197-201ENST00000583721 112 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 CLRN1-AS1.1-201ENST00000615643 79 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.56□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-215P-201ENST00000365169 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1189P-201ENST00000383958 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 RNU6-1056P-201ENST00000383996 107 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 SNORD38C-201ENST00000384381 69 ntBASIC2.55□□□□□ -2
NLRC3Q7RTR2 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.55□□□□□ -2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.7 ms