Protein–RNA interactions for Protein: Q16827

PTPRO, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPROQ16827 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR4762-201ENST00000585261 75 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 CYLC2-202ENST00000487798 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 HFM1-201ENST00000370425 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORA17.3-201ENST00000391159 129 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC120024.3-201ENST00000603167 156 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
PTPROQ16827 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.461-201ENST00000384263 103 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-763P-201ENST00000390865 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 ZGRF1-203ENST00000445203 6529 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-1084P-201ENST00000362498 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-1309P-201ENST00000363305 108 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-833P-201ENST00000363486 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 CARD18-203ENST00000532895 422 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL359821.1-201ENST00000605519 182 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 UBE2WP1-201ENST00000362030 340 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MIR335-201ENST00000362173 94 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPROQ16827 SNORA25.9-201ENST00000365087 128 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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PTPROQ16827 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC013791.1-201ENST00000616619 62 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL121890.5-201ENST00000620848 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-662P-201ENST00000384253 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RNU6-322P-201ENST00000516010 103 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.44-201ENST00000362676 108 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC003989.2-201ENST00000440224 169 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL122017.1-202ENST00000570612 319 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 Y_RNA.556-201ENST00000384677 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPROQ16827 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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PTPROQ16827 Y_RNA.637-201ENST00000459424 114 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 MIR5692C2-201ENST00000577959 77 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
PTPROQ16827 AL513534.2-201ENST00000603836 250 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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