Protein–RNA interactions for Protein: Q15878

CACNA1E, Voltage-dependent R-type calcium channel subunit alpha-1E, humanhuman

Predictions only

Length 2,313 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1EQ15878 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC018645.2-201ENST00000609151 472 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL662814.1-201ENST00000617364 121 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC-0.05□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR1-1-201ENST00000362147 71 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.181-201ENST00000363872 101 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1050P-201ENST00000410388 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-735P-201ENST00000410612 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 U6.73-201ENST00000619194 103 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-161P-201ENST00000363051 106 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORD113-7-201ENST00000363762 77 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-269P-201ENST00000391077 97 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR1257-201ENST00000408490 117 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL121872.1-201ENST00000420327 281 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 USP9YP12-201ENST00000450481 570 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MTND1P27-201ENST00000451117 902 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.706-201ENST00000516933 99 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU2-60P-201ENST00000517290 128 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORD11B-201ENST00000607707 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC022140.2-201ENST00000623500 188 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORD72-201ENST00000390994 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC073359.2-201ENST00000478814 351 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1129P-201ENST00000515964 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR4677-201ENST00000584153 80 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-938P-201ENST00000411285 103 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-693P-201ENST00000516134 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU7-43P-201ENST00000516554 64 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
CACNA1EQ15878 RNU6-107P-201ENST00000516643 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
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