Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.681-201ENST00000516445 113 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNA5SP285-201ENST00000516619 119 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SCARNA16.5-201ENST00000517114 183 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC113192.4-201ENST00000534666 547 ntTSL 4 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AL162413.1-201ENST00000603198 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AL359880.1-201ENST00000621879 266 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6V-201ENST00000384105 107 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC010424.1-201ENST00000506336 297 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-332P-201ENST00000391193 108 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6ATAC11P-201ENST00000408541 125 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC124864.2-201ENST00000624736 186 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORA63C-201ENST00000364578 129 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-302P-201ENST00000365249 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC073641.1-201ENST00000425192 429 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RNU6-408P-201ENST00000515910 100 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
USF2Q15853 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms