Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 AC104010.1-201ENST00000616889 150 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC-1.08□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RNU6-726P-201ENST00000364680 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RNU4-16P-201ENST00000364737 141 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RNU6-47P-201ENST00000383866 107 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 SNORA22B-201ENST00000383876 138 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 MIR9-2-201ENST00000384838 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 SSR1P2-201ENST00000415208 787 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RN7SKP19-201ENST00000516016 252 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 SNORA19.3-201ENST00000516165 130 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 AC084368.1-201ENST00000620935 65 ntBASIC-1.09□□□□□ -2.58
ALX1Q15699 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-660P-201ENST00000364566 109 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORD38B-201ENST00000384690 67 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MIR4703-201ENST00000577728 79 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.1□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORA1.2-201ENST00000365189 134 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 Y_RNA.439-201ENST00000384119 94 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORD38.3-201ENST00000516599 73 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC008147.1-201ENST00000551284 325 ntTSL 3 BASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC-1.11□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 Y_RNA.484-201ENST00000384389 103 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORD93-201ENST00000408813 74 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC104850.1-201ENST00000435940 476 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC021146.6-201ENST00000514659 117 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-475P-201ENST00000516073 104 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MIR3115-201ENST00000577915 68 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC010205.1-201ENST00000616668 449 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC009878.1-201ENST00000621819 340 ntBASIC-1.12□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORD115-44-201ENST00000365391 82 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 BX276092.1-201ENST00000427368 251 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 UBL5P4-201ENST00000562584 236 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-1.13□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL590002.1-201ENST00000406554 418 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 GRM7-AS3-203ENST00000424366 486 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 GPR143P-201ENST00000434155 205 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 Vault.3-201ENST00000516676 95 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AP000811.1-201ENST00000603803 651 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AL607023.1-201ENST00000620045 248 ntBASIC-1.14□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-431P-201ENST00000383874 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MT-TF-201ENST00000387314 71 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RPL30P16-201ENST00000419341 429 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 FGF14-AS1-202ENST00000451630 321 ntTSL 2 BASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MIR6851-201ENST00000617060 67 ntBASIC-1.15□□□□□ -2.59
ALX1Q15699 MIR30D-201ENST00000362283 70 ntBASIC-1.16□□□□□ -2.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.5 ms