Protein–RNA interactions for Protein: Q15436

SEC23A, Protein transport protein Sec23A, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC23AQ15436 UHMK1-204ENST00000545294 8117 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORD113-1-201ENST00000365321 69 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-1138P-201ENST00000365359 106 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.393-201ENST00000383936 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.497-201ENST00000384447 98 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.568-201ENST00000384742 113 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORD37.2-201ENST00000391075 66 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6ATAC37P-201ENST00000408328 131 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 TRBV12-1-201ENST00000479785 344 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 NPPA-AS1_2.1-201ENST00000618496 149 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-597P-201ENST00000365620 102 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 CLLU1-201ENST00000378485 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA3A-201ENST00000364113 130 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU4-11P-201ENST00000365287 132 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA19-201ENST00000384737 128 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU7-28P-201ENST00000516759 62 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 KRTAP25-1-201ENST00000416044 370 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC097639.2-201ENST00000603159 172 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SMARCAD1-201ENST00000354268 4912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 DNAH7-201ENST00000312428 12394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.01
SEC23AQ15436 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-768P-201ENST00000384683 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-131P-201ENST00000391144 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 AL606753.1-201ENST00000427435 87 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-365P-201ENST00000517113 106 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 Y_RNA.634-201ENST00000364811 113 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
SEC23AQ15436 MIR518A2-201ENST00000384966 87 ntBASIC2.43□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 231.4 ms