Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MIR101-1-201ENST00000362265 75 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-46P-201ENST00000383860 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 ATP6V0E1P1-201ENST00000412537 226 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 LINC01870-201ENST00000427042 390 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 HMGN2P22-201ENST00000427588 175 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC015845.1-201ENST00000579285 335 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC004543.1-201ENST00000418764 369 ntTSL 5 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.22□□□□□ -2.44
SYCP1Q15431 RNU6-1085P-201ENST00000363576 107 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 U8.17-201ENST00000391292 132 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-956P-201ENST00000458868 103 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AC010525.2-201ENST00000590920 195 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MTRNR2L2-201ENST00000604882 87 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.23□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORA9.1-201ENST00000362412 131 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.24□□□□□ -2.45
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SYCP1Q15431 UBE2V1P7-201ENST00000446395 340 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AC008608.1-201ENST00000603910 127 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
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SYCP1Q15431 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC-0.25□□□□□ -2.45
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SYCP1Q15431 RNU6-415P-201ENST00000516252 97 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 Y_RNA.172-201ENST00000363765 102 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 AC096720.1-201ENST00000604441 183 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
SYCP1Q15431 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
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