Protein–RNA interactions for Protein: Q14444

CAPRIN1, Caprin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPRIN1Q14444 MTCO2P33-201ENST00000402100 465 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC016909.1-201ENST00000415916 166 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 KCNQ1OT1_5.1-201ENST00000621902 226 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC008873.1-201ENST00000625051 138 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 BRDT-206ENST00000402388 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-60P-201ENST00000364792 103 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR30A-201ENST00000385092 71 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC245517.4-201ENST00000448601 281 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR3169-201ENST00000578032 83 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC098479.1-201ENST00000609225 154 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Six3os1_7.1-201ENST00000621512 201 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.270-201ENST00000364693 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORD31B-201ENST00000364977 69 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-975P-201ENST00000384296 105 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR7974-201ENST00000615835 79 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.37□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR424-201ENST00000362227 98 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 snoU2_19.4-201ENST00000364329 80 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.304-201ENST00000365011 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU7-141P-201ENST00000459304 62 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-346P-201ENST00000516288 111 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC025647.1-201ENST00000517879 253 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SUMO2P18-201ENST00000518873 252 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC136628.3-201ENST00000521868 290 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 AP001178.1-201ENST00000584679 268 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 KLRA1P-203ENST00000535939 2353 ntTSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 PPP2R5A-205ENST00000537030 1719 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-407P-201ENST00000365280 104 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 SNORA72.4-201ENST00000384174 132 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 Y_RNA.555-201ENST00000384673 110 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 TRAJ23-201ENST00000390514 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
CAPRIN1Q14444 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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