Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 SNORD116-28-201ENST00000516123 91 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR3668-201ENST00000582138 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL365265.1-201ENST00000621045 234 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 DEFB131A-201ENST00000334879 213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 SNORA63D-201ENST00000364359 132 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 Y_RNA.265-201ENST00000364677 108 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-200P-201ENST00000364743 107 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL627390.1-201ENST00000396055 340 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 COX6CP10-201ENST00000416832 224 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 JPX_2.1-201ENST00000614161 69 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-112P-201ENST00000363599 104 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR504-201ENST00000385065 83 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP109-201ENST00000391010 116 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP482-201ENST00000391269 118 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP61-201ENST00000516453 100 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC022217.4-201ENST00000604389 163 ntBASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.81□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU4-17P-201ENST00000365598 141 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR583-201ENST00000384846 75 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC011921.3-201ENST00000605540 361 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR411-201ENST00000362239 96 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 SNORA16B-201ENST00000364674 135 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR4709-201ENST00000577272 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 AC007370.2-201ENST00000506899 2694 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
PKP1Q13835 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.29-201ENST00000362570 113 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-1020P-201ENST00000363684 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.793-201ENST00000411222 111 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RPL30P13-201ENST00000418873 348 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-182P-201ENST00000516970 105 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC087685.1-201ENST00000587507 141 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC1.77□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR126-201ENST00000362291 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.785-201ENST00000384290 109 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 Y_RNA.644-201ENST00000459006 113 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
PKP1Q13835 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC1.76□□□□□ -2.13
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