Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MIR4263-201ENST00000584745 83 ntBASIC-0.75□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 Z94722.1-201ENST00000604328 474 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.76□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-1175P-201ENST00000365200 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNA5SP47-201ENST00000517230 109 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MIR3152-201ENST00000579801 74 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AL133215.3-201ENST00000609801 448 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AP001506.1-201ENST00000615444 211 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC-0.77□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 Y_RNA.391-201ENST00000383933 94 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MTCO2P16-201ENST00000436962 677 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC036101.1-201ENST00000449272 597 ntTSL 3 BASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 snoU13.16-201ENST00000459350 104 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-135P-201ENST00000516769 101 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 MIR5706-201ENST00000579841 80 ntBASIC-0.78□□□□□ -2.53
TCOF1Q13428 RNU6-1229P-201ENST00000364295 107 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR5692C1-201ENST00000585309 91 ntBASIC-0.79□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 Y_RNA.174-201ENST00000363781 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-282P-201ENST00000365357 103 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC009468.2-201ENST00000457372 366 ntTSL 5 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC134698.4-201ENST00000523451 826 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AL391834.2-201ENST00000609982 546 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SNORD113-6-201ENST00000363345 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SNORD28-201ENST00000384706 75 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR215-201ENST00000384858 110 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC078851.1-201ENST00000415918 298 ntTSL 3 BASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-1337P-201ENST00000516525 95 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.8□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-1048P-201ENST00000364054 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC107297.1-201ENST00000459991 176 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 CR383656.4-201ENST00000546909 122 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR548AD-201ENST00000584780 82 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR4788-201ENST00000639104 80 ntBASIC-0.81□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-996P-201ENST00000365438 107 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SCARNA11.2-201ENST00000517183 154 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AL022161.1-201ENST00000604390 213 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AL158050.2-201ENST00000605336 568 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC-0.82□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC133104.1-201ENST00000429100 218 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 AC108488.2-201ENST00000438485 421 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 PCMTD1P1-201ENST00000455560 355 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
TCOF1Q13428 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC-0.83□□□□□ -2.54
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