Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-163P-201ENST00000384396 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR1252-201ENST00000408861 65 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RPS20P10-201ENST00000451209 253 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-1137P-201ENST00000517073 99 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 RNU6-897P-201ENST00000517135 105 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR4680-201ENST00000580906 66 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC032019.2-201ENST00000584916 403 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
MSLNQ13421 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIRLET7C-201ENST00000362160 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.310-201ENST00000365063 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 TRAJ3-201ENST00000390534 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AL590004.1-201ENST00000405321 300 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-121P-201ENST00000410525 99 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-321P-201ENST00000410912 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 TRMT112P2-201ENST00000512910 132 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORA70.22-201ENST00000517160 124 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 LINC01378-205ENST00000615833 158 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.11-201ENST00000362375 109 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.222-201ENST00000364264 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.341-201ENST00000365341 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.527-201ENST00000384573 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIR452-201ENST00000385020 85 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIR15B-201ENST00000385045 98 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-1116P-201ENST00000517269 99 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC113195.1-201ENST00000579952 141 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC011825.2-201ENST00000583138 553 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 ZNF415-224ENST00000601493 2132 ntTSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 TPTE2-204ENST00000400103 1652 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.368-201ENST00000365547 113 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.383-201ENST00000383855 97 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.455-201ENST00000384230 98 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SEPT14P8-201ENST00000508026 178 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORA31.2-201ENST00000516019 134 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-496P-201ENST00000516145 99 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC044792.1-201ENST00000593294 196 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD113-5-201ENST00000607261 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 TRAJ36-201ENST00000614481 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIR376A1-201ENST00000616574 68 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 EYS-205ENST00000393380 5450 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.202-201ENST00000364083 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.214-201ENST00000364201 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 U8.5-201ENST00000364528 136 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-1187P-201ENST00000364771 110 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORA33.2-201ENST00000365413 134 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC103810.9-201ENST00000606688 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-806P-201ENST00000365147 105 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC117470.1-201ENST00000381974 330 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MLLT10P1-201ENST00000418346 262 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC048334.1-201ENST00000477975 159 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
MSLNQ13421 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
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