Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Length 867 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AL591926.4-201ENST00000616895 298 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.24□□□□□ -2.05
SP140Q13342 FSIP2-206ENST00000611759 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 RNY1P5-201ENST00000383890 115 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SP140Q13342 Y_RNA.432-201ENST00000384087 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SP140Q13342 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SP140Q13342 SNORA12.1-201ENST00000390873 148 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
SP140Q13342 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 RPS27P1-201ENST00000450552 247 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 RNU7-149P-201ENST00000516739 59 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
SP140Q13342 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 MIR3658-201ENST00000636291 56 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
SP140Q13342 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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SP140Q13342 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 SNORA48.3-201ENST00000391081 134 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 AL590705.2-201ENST00000420204 281 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 RNA5SP200-201ENST00000516360 103 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 AC090155.2-201ENST00000518854 267 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
SP140Q13342 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
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