Protein–RNA interactions for Protein: Q13247

SRSF6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF6Q13247 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 Y_RNA.370-201ENST00000365589 108 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 Y_RNA.423-201ENST00000384057 113 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-1103P-201ENST00000384150 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR1207-201ENST00000408249 87 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MTATP6P13-201ENST00000438531 667 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-1232P-201ENST00000516299 86 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC092378.2-202ENST00000569328 445 ntTSL 3 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AL355375.2-201ENST00000574825 175 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC245884.10-201ENST00000597355 337 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MTND1P7-201ENST00000632801 297 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC112487.2-201ENST00000637950 304 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR377-201ENST00000362145 69 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNY1P16-201ENST00000363063 111 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 SNORA72.3-201ENST00000365074 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-580P-201ENST00000365159 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-128P-201ENST00000383976 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU5A-2P-201ENST00000384337 116 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU7-87P-201ENST00000459343 62 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR6755-201ENST00000619993 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 snoU2-30.1-201ENST00000365012 70 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MT-TN-201ENST00000387400 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 SNORA26-201ENST00000391286 122 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AL365203.2-201ENST00000423444 196 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 HMGN2P32-201ENST00000444648 269 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RPL30P15-201ENST00000457129 321 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC012668.1-201ENST00000457625 228 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MTND3P7-201ENST00000474435 343 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 Y_RNA.659-201ENST00000515994 113 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RN7SKP287-201ENST00000516546 266 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 RNU6-782P-201ENST00000516852 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 IGKV1-22-201ENST00000524313 326 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AL050303.3-201ENST00000613704 284 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 MIR499B-201ENST00000636498 73 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 OSBPL1A-217ENST00000638614 84 ntTSL 5 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
SRSF6Q13247 AP003174.1-201ENST00000306533 376 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 Y_RNA.288-201ENST00000364854 92 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-929P-201ENST00000384429 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 MIR106A-201ENST00000384870 81 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-127P-201ENST00000390897 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC093730.1-201ENST00000508825 448 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 Y_RNA.660-201ENST00000516002 120 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU2-12P-201ENST00000517216 168 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 LRRC34P1-201ENST00000542742 915 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AP000753.3-201ENST00000604083 169 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-89P-201ENST00000606519 100 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 AC092954.2-201ENST00000609103 430 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 MIR410-201ENST00000362222 80 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
SRSF6Q13247 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms