Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
SEMA3BQ13214 SNORA1B-201ENST00000362535 133 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL512604.1-201ENST00000404812 257 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.626-201ENST00000411288 95 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNA5SP57-201ENST00000459463 123 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC055733.2-201ENST00000504737 340 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL035078.1-202ENST00000531627 413 ntTSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 TTC28-AS1_2.1-201ENST00000611117 157 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.515-201ENST00000384535 112 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-437P-201ENST00000459408 95 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RPS27P21-201ENST00000486977 252 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC068658.1-201ENST00000507509 388 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SNORA31.17-201ENST00000516953 127 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AP002004.2-201ENST00000531656 154 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-457P-201ENST00000363999 107 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.199-201ENST00000364014 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR499A-201ENST00000384903 122 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC018511.2-201ENST00000413431 189 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 BTF3P4-201ENST00000418852 495 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC130289.1-201ENST00000577321 73 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 GABRA2-209ENST00000510861 3411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.94□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR626-201ENST00000385032 94 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC108059.2-201ENST00000434626 151 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 HSPE1P9-201ENST00000440046 311 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 CFLAR-AS1-202ENST00000474886 223 ntTSL 3 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC100767.1-201ENST00000528178 123 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC104819.3-201ENST00000603264 540 ntTSL 4 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR8070-201ENST00000616510 88 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 FSD1L-201ENST00000374707 7062 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.24-201ENST00000362508 103 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.83-201ENST00000363005 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RNY1P10-201ENST00000363268 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.796-201ENST00000364268 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.799-201ENST00000364992 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.572-201ENST00000384757 98 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 RPS29P11-201ENST00000496507 171 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.92□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SEMA3BQ13214 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
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