Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 CYCTP-201ENST00000504253 315 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC025253.1-201ENST00000613623 543 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RNU6-20P-201ENST00000384106 107 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 Y_RNA.446-201ENST00000384178 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 SUMO1P2-201ENST00000452524 304 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC122707.1-201ENST00000502882 219 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 Z84484.1-202ENST00000612718 60 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AL109933.3-201ENST00000619095 188 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 AC027279.3-201ENST00000625055 122 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
IFT88Q13099 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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IFT88Q13099 MIR1185-1-201ENST00000408598 86 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR1298-201ENST00000408783 112 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC138393.2-201ENST00000414742 246 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RPS26P5-201ENST00000418544 335 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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IFT88Q13099 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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IFT88Q13099 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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IFT88Q13099 Y_RNA.653-201ENST00000459091 95 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC091951.2-201ENST00000500762 203 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.718-201ENST00000517110 102 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 uc_338.17-201ENST00000619633 179 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 AC099654.14-201ENST00000638599 341 ntBASIC0.62□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 Y_RNA.27-201ENST00000362540 103 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
IFT88Q13099 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC0.61□□□□□ -2.31
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