Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 SUMO1P3-201ENST00000439961 304 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 AC011604.1-201ENST00000545978 196 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 RNU2-4P-201ENST00000606190 192 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 MIR6845-201ENST00000613182 61 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
LMAN2Q12907 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL359851.1-201ENST00000569460 4997 ntBASIC2.09□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.240-201ENST00000364469 95 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 HMGN2P38-201ENST00000423806 265 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC090255.1-201ENST00000495779 349 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-1219P-201ENST00000516143 112 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-103P-201ENST00000363686 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR616-201ENST00000385293 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-341P-201ENST00000516973 96 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC022596.1-201ENST00000582895 302 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL353742.1-201ENST00000453455 224 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 SLCO1B3-202ENST00000381545 2805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 TEX15-203ENST00000638951 11341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.203-201ENST00000364106 102 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU4-41P-201ENST00000364426 143 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC074198.2-201ENST00000508153 258 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR4744-201ENST00000581563 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.267-201ENST00000364679 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIER3-202ENST00000381199 5188 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-1062P-201ENST00000383908 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 CYCSP49-201ENST00000420810 319 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC233266.1-201ENST00000454518 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.797-201ENST00000515977 94 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MRPS18CP4-201ENST00000535821 231 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR2681-201ENST00000581814 105 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC242852.1-201ENST00000612151 96 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC244015.1-201ENST00000622301 99 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-774P-201ENST00000363238 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-1019P-201ENST00000364424 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.464-201ENST00000384282 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 Y_RNA.621-201ENST00000411065 96 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 RPL23AP6-201ENST00000446637 472 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 snoU13.31-201ENST00000607291 104 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 AL021707.8-201ENST00000609428 183 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
LMAN2Q12907 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.09
LMAN2Q12907 Y_RNA.23-201ENST00000362496 106 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
LMAN2Q12907 RNU6-312P-201ENST00000364629 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
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