Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 SCARNA17-201ENST00000516183 144 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR4639-201ENST00000584938 69 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 SNORD114-14-201ENST00000362723 75 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR501-201ENST00000390204 84 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC109327.2-201ENST00000448339 378 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC093752.1-212ENST00000500559 453 ntTSL 1 (best) BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU6-504P-201ENST00000516568 104 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR3925-201ENST00000584674 77 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 CLPTM1LP1-201ENST00000604519 484 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AL158063.1-201ENST00000615349 536 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC-0.86□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR148A-201ENST00000362215 68 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 SNORD14E-201ENST00000364009 85 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR518F-201ENST00000384973 87 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR4752-201ENST00000579672 72 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 hsa-mir-548d-1.1-201ENST00000636914 97 ntBASIC-0.87□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 Y_RNA.253-201ENST00000364562 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU6-1165P-201ENST00000410119 107 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU2-13P-201ENST00000515909 113 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 SCARNA20.2-201ENST00000516052 116 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 Y_RNA.666-201ENST00000516187 112 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 NDUFV2-AS1-202ENST00000583081 399 ntTSL 5 BASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC-0.88□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR588-201ENST00000384900 83 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR378F-201ENST00000578143 78 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 RNU1-29P-201ENST00000606574 126 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 MIR6740-201ENST00000618268 113 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
PTPRMP28827 AC244669.1-204ENST00000621564 178 ntBASIC-0.89□□□□□ -2.55
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PTPRMP28827 AC107023.1-201ENST00000552757 356 ntTSL 5 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
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PTPRMP28827 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.92□□□□□ -2.56
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PTPRMP28827 Y_RNA.42-201ENST00000362660 108 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 Y_RNA.371-201ENST00000365591 113 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 RNU4-83P-201ENST00000410863 133 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
PTPRMP28827 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC-0.93□□□□□ -2.56
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