Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.242-201ENST00000364473 110 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.553-201ENST00000384670 102 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR522-201ENST00000385071 87 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
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PTPRBP23467 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 snoU13.2-201ENST00000459201 104 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR4300-201ENST00000581016 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AP001180.6-201ENST00000584918 159 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 SNORA25.18-201ENST00000607153 114 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR3674-201ENST00000636576 68 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR3662-201ENST00000637030 95 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.02□□□□□ -2.41
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PTPRBP23467 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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PTPRBP23467 MIR570-201ENST00000384917 97 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 USP9YP30-201ENST00000430729 455 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
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PTPRBP23467 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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PTPRBP23467 SNORD71-201ENST00000411292 86 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC0.01□□□□□ -2.41
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PTPRBP23467 SNORD118-201ENST00000363593 134 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.157-201ENST00000363638 102 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 RNU6-205P-201ENST00000390858 107 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 MIR18B-201ENST00000454574 71 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
PTPRBP23467 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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