Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-1212P-201ENST00000517023 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU7-128P-201ENST00000517247 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 U6.108-201ENST00000637764 58 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-136P-201ENST00000384663 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 SNORA8.3-201ENST00000384679 139 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AL356379.1-201ENST00000414105 126 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC069257.2-201ENST00000441819 155 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC015720.1-201ENST00000565251 277 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 hsa-mir-548d-2.1-201ENST00000582790 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AP003357.1-201ENST00000604497 148 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC005972.2-201ENST00000604690 348 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-383P-201ENST00000410864 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AL162725.1-201ENST00000435405 301 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU7-94P-201ENST00000459576 63 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-453P-201ENST00000516819 85 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MT-ATP8-201ENST00000361851 207 ntAPPRIS P1 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.182-201ENST00000363880 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.226-201ENST00000364337 114 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-1323P-201ENST00000384025 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-804P-201ENST00000384286 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR526A2-201ENST00000390198 65 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AP001043.2-201ENST00000434589 288 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 GHRL-208ENST00000439975 326 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC087362.2-201ENST00000529325 256 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC018630.2-201ENST00000534866 2403 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC127455.1-201ENST00000565496 145 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
CTIFO43310 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR520G-201ENST00000385064 90 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC091021.1-201ENST00000468051 388 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RN7SKP164-201ENST00000516138 266 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 RNU7-116P-201ENST00000516940 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MTND5P41-201ENST00000517498 206 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR3133-201ENST00000583157 78 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
CTIFO43310 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.229-201ENST00000364347 113 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-125P-201ENST00000384505 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR562-201ENST00000384894 95 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MT-TT-201ENST00000387460 66 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU4-61P-201ENST00000411243 107 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RPS4XP11-201ENST00000446897 772 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AP003097.2-201ENST00000530126 178 ntTSL 3 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR3144-201ENST00000579460 79 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.02□□□□□ -2.09
CTIFO43310 AC008555.8-201ENST00000623602 2168 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR367-201ENST00000362299 68 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.8-201ENST00000362353 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNA5SP276-201ENST00000362580 94 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-746P-201ENST00000384112 109 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU6-187P-201ENST00000384139 106 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 Y_RNA.506-201ENST00000384494 102 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 MIR1287-201ENST00000408492 90 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
CTIFO43310 RNU2-7P-201ENST00000410794 178 ntBASIC2.01□□□□□ -2.09
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