Protein–RNA interactions for Protein: O43186

CRX, Cone-rod homeobox protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 299 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRXO43186 RNA5SP63-201ENST00000391225 112 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC092567.1-201ENST00000452397 251 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
CRXO43186 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 U8.19-201ENST00000459095 133 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR8087-201ENST00000612745 78 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.540-201ENST00000384638 111 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR613-201ENST00000385248 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR802-201ENST00000390235 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR4290-201ENST00000583807 95 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
CRXO43186 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC018638.8-201ENST00000588755 281 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.36-201ENST00000362602 112 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNA5SP117-201ENST00000365294 118 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1319P-201ENST00000390855 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-747P-201ENST00000390928 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-241P-201ENST00000391148 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-447P-201ENST00000410293 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1118P-201ENST00000410382 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1076P-201ENST00000410397 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-355P-201ENST00000410427 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-791P-201ENST00000410467 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-705P-201ENST00000410601 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1100P-201ENST00000410691 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-860P-201ENST00000410860 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1217P-201ENST00000411276 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-785P-201ENST00000411324 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-1088P-201ENST00000516850 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 U6.90-201ENST00000614007 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 U6.70-201ENST00000620287 104 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
CRXO43186 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 SNORA32.1-201ENST00000364514 115 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNA5SP496-201ENST00000391240 109 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU6-855P-201ENST00000410395 104 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 AL583859.1-201ENST00000455871 335 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 AC141557.1-201ENST00000540982 400 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 OMD-201ENST00000375550 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.16□□□□□ -2.44
CRXO43186 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
CRXO43186 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
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