Protein–RNA interactions for Protein: B1AMM8

LINC00587, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00587, humanhuman

Predictions only

Length 73 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00587B1AMM8 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 PCMTD1P2-201ENST00000565017 355 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC-1.92□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.13-201ENST00000362403 112 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC-1.93□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AL512286.1-201ENST00000439244 400 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SNORD57-201ENST00000448188 72 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 MIR4306-201ENST00000583390 91 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.167-201ENST00000363735 109 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-291P-201ENST00000384720 107 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC008883.1-201ENST00000506562 193 ntTSL 3 BASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU7-181P-201ENST00000517234 74 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.517-201ENST00000384551 106 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-535P-201ENST00000384722 107 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SNRPGP10-201ENST00000432323 225 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 HSPE1P23-201ENST00000509838 286 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SNORA25.13-201ENST00000516395 103 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 PIGPP4-201ENST00000584447 307 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AL121895.2-201ENST00000619558 447 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AP002371.2-201ENST00000624450 503 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-502P-201ENST00000362419 108 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SNORD115-2-201ENST00000362842 82 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SNORA24-201ENST00000384096 131 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-533P-201ENST00000384144 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RPL39P25-201ENST00000449384 154 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU6-410P-201ENST00000517006 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AP003181.2-201ENST00000528941 181 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Z97988.1-201ENST00000637697 135 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AL596211.1-201ENST00000569873 2277 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 RNU4-32P-201ENST00000363404 141 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.142-201ENST00000363491 102 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.495-201ENST00000384435 112 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 MIR516B1-201ENST00000385211 90 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AL358176.1-201ENST00000457477 357 ntTSL 5 BASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 AL512427.1-201ENST00000618593 349 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.72
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.374-201ENST00000365606 101 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-1133P-201ENST00000410963 100 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AL136370.1-201ENST00000608166 691 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AL049777.1-201ENST00000622740 518 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC126544.2-201ENST00000625174 749 ntBASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 NAA50-211ENST00000630058 177 ntTSL 5 BASIC-1.98□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.450-201ENST00000384198 113 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 MTATP6P17-201ENST00000431030 672 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AL445193.1-201ENST00000441183 141 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 SCARNA18B-201ENST00000458806 135 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC090503.1-201ENST00000548029 729 ntTSL 3 BASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AL158209.2-201ENST00000619266 216 ntBASIC-1.99□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 SNORD110-201ENST00000408189 75 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.608-201ENST00000410647 95 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 MTCO2P27-201ENST00000420740 428 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC006210.1-201ENST00000424882 111 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC092958.2-201ENST00000476987 492 ntTSL 3 BASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC016550.1-201ENST00000505348 785 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC-2□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.472-201ENST00000384322 102 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.697-201ENST00000516776 113 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-706P-201ENST00000517229 104 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 POLR3GP1-201ENST00000594073 261 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 AC011458.1-201ENST00000604034 617 ntBASIC-2.01□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-403P-201ENST00000363163 104 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.302-201ENST00000364997 102 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-1336P-201ENST00000383886 109 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-721P-201ENST00000410155 105 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-1007P-201ENST00000516586 107 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 MIR4320-201ENST00000636981 65 ntBASIC-2.02□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-490P-201ENST00000362985 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 SNORD116-12-201ENST00000384468 92 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-455P-201ENST00000384681 107 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
LINC00587B1AMM8 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC-2.03□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.3 ms