Protein–RNA interactions for Protein: A5PLN9

TRAPPC13, Trafficking protein particle complex subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC13A5PLN9 SNORD114-16-201ENST00000363044 70 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-767P-201ENST00000384132 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1119P-201ENST00000384349 108 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-700P-201ENST00000391043 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 DIP2A-IT1-201ENST00000442434 428 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 PLS1-AS1-201ENST00000485338 346 ntTSL 3 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC019235.1-201ENST00000503847 207 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC027343.1-201ENST00000504765 407 ntTSL 4 BASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RPL23AP91-201ENST00000569211 455 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR4791-201ENST00000607666 84 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 uc_338.6-201ENST00000613544 171 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Pinc.1-201ENST00000616452 154 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORA72-201ENST00000384339 132 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 OPRPN-201ENST00000399575 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD100-201ENST00000408573 76 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR1197-201ENST00000408818 88 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC090844.1-201ENST00000422019 156 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.714-201ENST00000517065 90 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNA5SP330-201ENST00000517096 96 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC006380.1-201ENST00000603598 186 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC-0.07□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.205-201ENST00000364128 113 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.258-201ENST00000364613 105 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.567-201ENST00000384736 106 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR938-201ENST00000401216 83 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 KCNMA1-AS2-201ENST00000428936 427 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SEPT7P4-201ENST00000437076 306 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC017015.2-201ENST00000497946 376 ntTSL 2 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 LINC02277-202ENST00000556472 453 ntTSL 3 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR3678-201ENST00000578455 94 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC090897.1-201ENST00000580909 226 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR4264-201ENST00000583520 66 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 uc_338.4-201ENST00000616635 176 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 uc_338.16-201ENST00000621804 95 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC098679.4-201ENST00000624241 654 ntBASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 VPS35-212ENST00000640313 141 ntTSL 5 BASIC-0.08□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.537-201ENST00000384626 109 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-62P-201ENST00000458856 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 RNU7-102P-201ENST00000458948 62 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 MIR5190-201ENST00000581537 80 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC240442.1-201ENST00000616055 283 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC024614.3-201ENST00000637860 256 ntBASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 KIF20B-201ENST00000260753 6306 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.09□□□□□ -2.42
TRAPPC13A5PLN9 AC010332.2-201ENST00000613083 1904 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.77-201ENST00000362962 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORA36.1-201ENST00000363424 132 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-268P-201ENST00000364174 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-442P-201ENST00000383968 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-364P-201ENST00000384387 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 LINC01487-202ENST00000490497 423 ntTSL 3 BASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC011352.1-201ENST00000512300 793 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-830P-201ENST00000516353 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
TRAPPC13A5PLN9 AC133485.4-201ENST00000561835 220 ntBASIC-0.1□□□□□ -2.43
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