Protein–RNA interactions for Protein: W8DXL4

Lrit3, Leucine-rich repeat, immunoglobulin-like domain and transmembrane domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 681 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrit3W8DXL4 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Lrit3W8DXL4 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
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