Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2W8

Gria4, Glutamate receptor 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria4Q9Z2W8 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gria4Q9Z2W8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gria4Q9Z2W8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms