Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2D8

Mbd3, Methyl-CpG-binding domain protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3Q9Z2D8 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Mbd3Q9Z2D8 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Mbd3Q9Z2D8 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms