Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cldn6Q9Z262 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cldn6Q9Z262 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms