Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1Q9

Vars, Valine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VarsQ9Z1Q9 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
VarsQ9Z1Q9 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
VarsQ9Z1Q9 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms