Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1L5

Cacna2d3, Voltage-dependent calcium channel subunit alpha-2/delta-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna2d3Q9Z1L5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Cacna2d3Q9Z1L5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Cacna2d3Q9Z1L5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms