Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sema4fQ9Z123 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms