Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0W1

Ngfr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NgfrQ9Z0W1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
NgfrQ9Z0W1 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
NgfrQ9Z0W1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms